Святитель Агапит происходил из римского аристократического рода, его отец был священнослужителем, а вот дата рождения будущего Папы неизвестна.
Он был ревнителем веры Христовой и вел праведную жизнь, чем завоевал всеобщее уважение. В 535 году святого Агапита избрали Папой Римским (57-й). На момент избрания он служил архидиаконом.
Во время своего непродолжительного папства, Агапит подтвердил решения Карфагенского собора, согласно которым, те из епископов, кто впал в арианскую ересь, были лишены права возвращения в лоно Церкви.
Когда Византия готовилась к нападению на Италию, остготский король Теодагад направил Папу Агапита для мирных переговоров в Константинополь, чтобы повлиять на императора Юстиниана (527-565), что в итоге не помогло.
На пути святому встретился один человек, который был немым и страдал от хромоты. Римский епископ исцелил этого человека от хромоты, а после причащения, к нему еще вернулась и речь. По прибытии в Константинополь Папа исцелил незрячего нищего.
В то время столице Византии был созван собор, в работе которого принял участие и святой Агапит, защищая истинную веру от лжеучения еретика Северия Антиохийского, учившего, что Тело Иисуса Христа было тленным, подобно телу каждого человека.
В Константинополе святой заболел и умер в 536 году. Позже тело Папы было перевезено в Рим и погребено в соборе Святого Петра.
Часть мощей святителя находится в Николаевском монастыре во Флориде, близ города Форт-Майерс.
Память Папы Агапита Православная Церковь чтит 30 апреля.